El PLH es uno de los partidos políticos más antiguos de Honduras. Se fundó en 1891, incorporando a sectores reformistas que se concentraban en las grandes ciudades, principalmente en Tegucigalpa. El partido es miembro de la Internacional Liberal y se presenta como un adversario histórico del Partido Nacional de Honduras (PNH). A pesar de su longeva presencia en la historia política hondureña, el PLH no logró su primera victoria sino hasta las elecciones de 1956, con Ramón Villeda Morales (1909-1971), año en el que la junta militar perdió el poder que detentaba desde 1955.
El gobierno de Ramón Morales estuvo marcado por un acercamiento a las capas populares mediante la introducción de la legislación social, beneficios sociales y las primeras leyes de protección a los trabajadores. Esa política social afectó a los intereses de las grandes empresas internacionales, en especial los de la United Fruit Company, lo que desembocó en un nuevo golpe militar, en el año 1963. El PLH recién volvería al poder con el inicio de un efectivo proceso de redemocratización del país.
En 1981, Roberto Suazo Córdova resultó electo presidente y asumió el cargo en 1982. Su preocupación central fue la de pacificar el país, buscando garantizar la estabilidad interna de la frágil política hondureña. El liberal José Azcona del Hoyo, electo en 1985, fue el sucesor de Suazo Córdova en su cargo. Luego de un período de predominancia del PNH, el PLH retornó al poder con la elección de Carlos Roberto Reina Idiáquez, quien gobernó entre 1994 y 1998. Carlos Roberto Flores, también liberal, lo sucedió y gobernó Honduras entre los años 1998 y 2002. En las elecciones de 2001, el PLH fue derrotado por el PNH, tanto en las elecciones presidenciales como en las legislativas, en las cuales sólo accedió a 55 de las 128 bancas en disputa.
Manuel Zelaya fue elegido presidente en 2006 por el PLH, y terminó destituido del cargo en 2009. Su vice, Roberto Micheletti, también del partido, completó el mandato. En enero de 2010, Juan Olando Hernández, del Partido Nacional, se eligió presidente. En 2011, de vuelta a la escena política, Manuel Zelaya fundó el Partido Libertad y Refundación (Libre), el cual se consolidó en las elecciones del 2013 como la segunda fuerza política del país, rompiendo el bipartidismo PLH-PN.
