El PNH es uno de los partidos políticos más tradicionales de Honduras. Se fundó en 1918 y representa al sector conservador. Históricamente tuvo su principal base política en los sectores agrarios, tal como sucedió con diversas agrupaciones políticas oligárquicas en el resto de los países hispanoamericanos. El período que comprende los años 1933 y 1957 fue el de su mayor predominio político. El general Tiburcio Carías Andino (1876-1969), fundador del PNH, asumió la presidencia en 1932 y se mantuvo en el poder hasta el año 1949. Sin embargo, las elecciones presidenciales fueron vencidas por el PNH a través de su candidato Juan Manuel Gálvez, quien asumió el mandato el 1.º de enero de 1949 y fue sucedido por Julio Lozano Díaz. La inestabilidad política hondureña, signada por elecciones anuladas (como el caso de las elecciones de 1956), golpes militares y un período de hegemonía de los liberales, mantuvo al PNH alejado del poder. El partido retornaría al gobierno con las elecciones de 1989, que le dieron la victoria a Rafael Leonardo Callejas Romero, presidente entre los años 1990 y 1994.
Tras la victoria del Partido Liberal de Honduras (PLH) y de la presidencia de Carlos Roberto Flores (1998-2002), el PNH regresó al poder con la elección del candidato presidencial Ricardo Rodolfo Maduro, en noviembre del 2001. En esas mismas elecciones, el PNH consiguió 61 de los 128 escaños del Congreso hondureño. El partido permaneció en la presidencia con Porfírio Lobo, quien venció las elecciones en 2009 e hizo su sucesor, Juan Orlando Hernández, en 2013.